El ejercicio, se ha observado, puede disminuir los episodios de migraña, padecimiento que es muy frecuente entre la población y por tanto tiene un alto impacto socioeconómico. Se plantea los efectos del ejercicio sobre la migraña dependerán de la modalidad que se practique, ya sea aeróbico o de fuerza. El entrenamiento de fuerza, se ha registrado, tiene mayores efectos sobre los episodios de migraña, esto seguido del ejercicio aeróbico de alta intensidad. Se plantea que lo anterior sucede debido a que el fortalecimiento de los músculos principales del cuello, los hombros y las extremidades superiores mediante el entrenamiento de fuerza disminuyen los síntomas de la migraña. En especial al fortalecer lso musculos del cuello se pueden generar cambios en el sistema trigémino-cervical, el cual es un punto neuroanatómico fuertemente asociados los trastornos de migraña. En lo que corresponde al ejercicio aeróbico de alta intensidad su influencia en las migrañas se puede relacionar con la producción de moléculas endógenas de intensidad específica involucradas en la hipoalgesia mediada por el ejercicio. Por ejemplo, distintas investigaciones han mostrado, que durante el ejercicio aeróbico se secreta endorfina periférica y en la unión del receptor opioide lo cual se relaciona con una disminución de las molestias de la migraña. Todo esto nos muestra que el ejercicio en distintas modalidades puede ser tomado como complemento en el tratamiento de la migraña, aunque, este padecimiento es deseable sea tratado y monitorizado por profesionales especializados. 

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